深汕合作區是由深圳和汕頭共同打造的一個特殊經濟區域，其行政管理和政策規定也有所不同。所以，深圳戶口在深汕合作區申請保障房的流程和條件也與深圳市內略有不同。

具體來說，深圳戶口在深汕合作區申請保障房需要滿足以下條件

1.符合深汕合作區保障房申請條件

與深圳市內相同，深汕合作區的保障房申請條件也包括家庭人均住房面積達不到規定標準、家庭經濟狀況較為困難等。具體條件可在當地住房保障部門進行查詢。

2.在深汕合作區有穩定的就業或居住證明

在申請保障房時，需要提供在深汕合作區的穩定就業證明或居住證明。如果是在深圳市內工作或居住，需要提供相關證明文件。

3.在深汕合作區繳納社保或個稅

在深汕合作區申請保障房時，需要提供近一年的社保或個稅繳納證明。如果是在深圳市內繳納社保或個稅，也需要提供相關證明文件。

4.符合深汕合作區的房屋產權規定

在深汕合作區申請保障房時，需要符合當地的房屋產權規定。具體規定可在當地住房保障部門進行咨詢。

總之，深圳戶口在深汕合作區申請保障房需要符合當地的政策規定和條件，提供相關證明文件，并在當地住房保障部門進行申請。