深圳和惠州都是珠三角地區的經濟重鎮，各有優勢，公司選擇注冊地也應因地制宜。

深圳注冊公司流程相對簡便，費用也不高。通常情況下，注冊公司的費用在500元左右，且常常會附贈做賬報稅服務。其他可能涉及到的費用有核名、商務掛靠地址、刻章、做賬報稅和銀行開戶等。然而，這些費用并不是固定的，可因不同地區、不同公司而異。

相對來說，惠州的注冊流程可能略顯復雜，費用也可能較高。但優勢在于，惠州是南方沿海重要的裝備制造業和電子信息產業基地，而且物流和交通也十分發達，相對便宜，這對涉及到這些領域的企業來說，將是個非常不錯的選擇。

在選擇注冊地時，公司需要考慮以下幾個因素：

首先是企業規模，其次是行業特點，還有地方政策支持力度，及當地營商環境，以及注冊流程的方便程度等等。

在準備注冊公司時，需要準備相關材料，包括公司設立登記申請書、公司章程、法人或股東身份證及其復印件、代理人身份證明等。每個地方可能相關材料的要求有一定的差別，公司在辦理注冊前，需要先了解清楚當地的要求，以避免浪費時間和金錢。

總之，選擇注冊地需要結合企業實際情況和所處環境、行業特點等多方面考慮，從而使公司的發展和經營更順暢。