總體來說，在深圳，公司記賬代理費用每年基本在2000-5000元之間。小規模納稅人的費用相對較低，普通納稅人的費用相對較高。具體收費標準還是要根據不同企業的需求和復雜程度進行綜合考慮。同時，建議企業在選擇記賬代理服務時要進行謹慎評估，選取可靠的服務機構或個人，保證穩定經營和合規運營。