深圳福田區代理記賬也有一些缺點。首先，代理記賬費用一般比自己做要高。對于收入不夠多的小企業來說，如何合理控制成本是一個難題。其次，代理記賬是由第三方公司來處理企業財務，這就意味著企業需要向外部泄露財務信息。對于一些企業來說，這可能是不愿意接受的。此外，深圳的會計市場非常競爭，有一些朝三暮四的記賬公司，做事不夠專業，可能會給企業帶來麻煩。如果企業不慎選擇了這樣的代理記賬公司，代價可能會很大。最后，雖然代理記賬可以減輕企業的工作量，但是沒有獨立完成財務工作的經驗，企業可能會對自己的財務狀況失去掌控。

總之，深圳福田區代理記賬具有一定的優勢和缺點，企業在選擇記賬方式時應根據自身情況權衡利弊。無論選擇自己做還是代理記賬，企業都應該保持財務管理的專業性和規范性，避免財務風險。