深圳公司注銷后，涉及到稅務局的清稅流程，需要注意很多事項。總的來說，注銷公司不是一件簡單的事情，費用昂貴，流程復雜繁瑣。以下是需要注意的幾點：

第一，注銷公司的管理流程非常復雜繁瑣。注銷公司需要從工商局備案開始，經過注冊登記、國稅局申請注銷、地稅局申請注銷、工商局提交注銷文件、代碼注銷、銀行注銷等多個流程，時間也需要2個月至6個月不等。如果是分公司注銷，則需要更長的時間。因此，需要提前做好準備，確保資料齊全，以免耽誤時間。

第二，注銷公司需要來回多次，注銷資料需要很多。整個流程需要很多次來回跑國稅局、地稅局、工商局、銀行等各個機構，如果處理不當，可能浪費很多時間。此外，注銷公司還需要整理企業所有賬簿、憑證、財務會計報表等資料，并上傳國稅、地稅報表，這也是一項不小的工作。

第三，注銷納稅或巨額罰款的情況。如果公司在注銷時出現了問題，比如租金發票未開具、存在偷稅漏稅等情況，注銷手續和成本都會增加，甚至涉及到巨額罰款。因此，在平時經營中就要注意合法合規經營，避免在注銷時出現問題。

第四，不注銷公司的后果。如果不注銷公司，未來涉及到相關事項會受到限制，比如法定代表人不能領取養老保險、貸款買房或移民；國稅、地稅無法在稅務部門登記，涉及個人欠稅時，公司會計信息將予以公示和管理；企業法定代表人還有可能被禁止出境等。因此，如果公司已經不能經營下去，及時注銷是必要的。

綜上所述，深圳注銷公司稅務局清稅流程需要注意復雜繁瑣、資料準備、避免出現納稅或罰款問題以及不注銷公司的后果等問題。為了順利注銷公司，需要提前了解相關流程，積極配合，及時處理相關事項，以確保注銷成功。