深圳企業如需辦理出口退稅申請注銷，需要遵循一定的法律程序。首先，企業應召開股東會或股東代表會議，通過決議解散企業，并指定清算組成員進行清算工作。然后清算組成員要召集債權人和債務人確認、清償和處理債權債務，編制清算方案并報批后實施。接著，清算組成員需要到所屬稅務機關辦理稅務注銷手續，領取稅務注銷證明。同時，需要到企業開戶銀行注銷企業銀行賬戶。

完成稅務和銀行注銷后，持清算組成員的身份證明、稅務注銷證明、企業法人營業執照、開戶銀行注銷證明、注銷申請表等資料，到深圳市工商行政管理局辦理企業注銷。如條件允許，可以委托相關服務機構代理辦理。所需資料包括《深圳市企業注銷申請表》、企業法人營業執照原件及復印件、稅務注銷證明原件及復印件、開戶銀行注銷證明原件及復印件、清算方案、法人身份證原件及復印件、注銷委托書（如委托代理注銷）、其他相關證明文件（如社保、財務報表等）。

一般來說，注銷企業需要2-5個月以上的時間。簡易注銷是公司沒有任何異常，無稅務欠款，未開展經營活動，無債權債務的有限公司，可以走簡易注銷流程，一般需要20個工作日。而一般注銷流程及時間就會相對長些，因為注銷需要清算組備案公告、債權人公告45天，稅務注銷，清稅證明，公告期到后才能注銷工商、銀行，如果出現問題，延長注銷時間。注銷企業的費用在2000-5000左右，具體還要根據企業情況而定。

總之，深圳企業辦理出口退稅申請注銷需要遵循一定的法律程序，比較復雜。企業在注銷前應充分了解相關規定和流程，委托專業服務機構代理辦理注銷申請可以更方便快捷，避免出現繁瑣的手續和不必要的損失。同時，各企業對自身情況也應有充分的認識和調整，避免不必要的法律問題。