深圳企業注銷公司的申請流程是一個涉及到多個部門和細節的復雜過程。一家企業將要注銷公司時，必須先召開股東會或者股東代表會議，通過決議解散企業，并指派清算組成員進行清算工作。

清算組成員的職責是依法召集債權人和債務人，確認債權債務，編制清算方案，并報批后實施。接下來，清算組成員應該前往企業所屬稅務機關辦理稅務注銷手續，并領取稅務注銷證明。此外，清算組成員需要前往企業開戶銀行注銷企業銀行賬戶。

最后，持清算組成員身份證明、稅務注銷證明、企業法人營業執照、開戶銀行注銷證明、注銷申請表等資料到深圳市工商行政管理局辦理企業注銷。同時，企業應前往所屬社會保險機構辦理社保注銷手續。

企業可以通過以下三種方式辦理注銷手續：首先，在深圳市工商行政管理局網站上下載《深圳市企業注銷申請表》，并填寫完整。然后，持上述資料和申請表到深圳市工商行政管理局辦理窗口，進行現場審核和辦理。如條件允許，可以委托專業服務機構如律師事務所、會計師事務所等代理辦理相關手續。

在注銷公司的過程中，需要提交一些必要的資料和證件，包括《深圳市企業注銷申請表》、企業法人營業執照原件和復印件、稅務注銷證明原件和復印件、開戶銀行注銷證明原件和復印件、清算方案、法人身份證原件和復印件、注銷委托書等。同時，像社保、財務報表等其他證明文件也應該準備齊全。

注銷公司的所需時間因情況而異。簡易注銷的有限公司沒有任何異常，無稅務欠款，未開展經營活動，無債權債務，需要20個工作日左右。一般注銷流程及時間就會相對長些，因為注銷需要清算組備案公告、債權人公告45天，稅務注銷，清稅證明等。注銷公司的費用一般在2000-5000元之間，具體還是要看公司的情況。

總的來說，注銷公司的申請流程比較復雜，需要企業按照規定的程序準備資料和證件。如果公司不經營，一定要及時注銷，否則經營異常會對法人造成不良影響。