作為深圳企業，注銷后如何申請退稅是大家關注的一個問題。在完成企業注銷之后，企業需要辦理稅務注銷手續，領取稅務注銷證明。在稅務注銷證明拿到之后，就可以申請退稅了。

首先，企業需要在稅務局辦理稅務注銷手續。辦理稅務注銷需要提供企業注銷相關材料，如企業法人營業執照、稅務注銷證明，開戶銀行注銷證明等，具體要求可以到當地稅務局查詢。

在辦理稅務注銷手續期間，企業需要備齊購進和銷售的發票等相關的票據材料。企業會根據相關規定進行退稅申請，如增值稅、所得稅、企業所得稅等。

對于退稅申請，企業可以在當地稅務局申請或者通過電子稅務局在線提交。一般情況下，稅務局會在15個工作日內對申請進行審核，審核通過后，企業需要到當地稅務局領取退稅款項。

需要注意的是，不同的退稅種類，退稅辦理時間也不盡相同。一般來說，增值稅退稅需要5個工作日，企業所得稅退稅需要15個工作日，不同情況下退稅申請的時間也會有所不同。因此，企業在申請退稅前需要對退稅種類和時間進行了解。

總體來說，深圳企業注銷后進行退稅需要準備的材料和辦理過程較為復雜，企業需要仔細核對相關材料，并按照規定的流程辦理。希望企業在進行注銷和退稅時能夠順利完成，確保自己的經營合法合規。