深圳企業注銷行政許可申請是一個需要仔細規劃和準確執行的復雜過程，因此，任何一家深圳公司在注銷之前，都應該慎重考慮這一決定，并制定詳細的計劃。

首先，必須召開股東會或者股東代表會議，通過決議解散企業，并委派清算組成員進行清算工作。然后，清算組成員應當依法召集債權人和債務人進行債權債務的確認、清償和處理，編制清算方案并報批后實施。

接下來，清算組成員應到所屬稅務機關辦理稅務注銷手續，領取稅務注銷證明。還應到企業開戶銀行注銷企業銀行賬戶。持清算組成員的身份證明、稅務注銷證明、企業法人營業執照、開戶銀行注銷證明、注銷申請表等資料到深圳市工商行政管理局辦理企業注銷。最后，企業應到所屬社會保險機構辦理社保注銷手續。

企業可以通過兩種方式來完成深圳營業執照注銷流程：一是自己去到深圳市工商行政管理局，遞交材料并且進行面對面審核和辦理；二是委托相關服務機構代理辦理。這些服務機構包括律師事務所、會計師事務所等專業服務機構。這些機構會根據企業情況提供相應的注銷服務，并代為辦理相關手續。

在進行深圳營業執照注銷流程時，需要準備各種資料，包括《深圳市企業注銷申請表》，企業法人營業執照原件及復印件，稅務注銷證明原件及復印件，開戶銀行注銷證明原件及復印件，清算方案，法人身份證原件及復印件，注銷委托書（如委托代理注銷），以及其他相關的證明文件（如社保、財務報表等）。

一般情況下，深圳營業執照注銷流程需要2-5個月以上的時間。注銷分為簡易注銷和一般注銷。簡易注銷是公司沒有任何異常，無稅務欠款，未開展經營活動，無債權債務的有限公司可以走簡易注銷流程。簡易注銷一般需要20個工作。如果是一般注銷流程，時間就會相對長些，因為注銷需要清算組備案公告、債權人公告45天，稅務注銷，清稅證明等等。一般注銷不僅需要時間長，還有往返多個部門之苦。

在進行深圳營業執照注銷時，企業可能會面臨著一些費用，費用在2000-5000之間。具體費用取決于公司的狀況，如果公司有異常的話，費用會更昂貴。因此，企業應該提前計算好所需的費用，并且在注銷前進行詳細的了解，以確保沒有失誤。

總之，深圳企業注銷行政許可申請是一個復雜而又繁瑣的過程。但是，通過仔細計劃和準確執行，企業可以順利完成注銷手續，避免后續不必要的麻煩。