對于深圳的企業來說，辦理注銷手續需要注意以下幾點民事糾紛風險：

一、債權債務的確認：在解散企業時，應該召開股東會或股東代表會議，通過決議解散企業，并委派清算組成員進行清算工作。清算組成員應依法召集債權人和債務人進行債權債務的確認、清償和處理。如果當事人不能達成一致，可能會引起訴訟糾紛，增加注銷時間和費用。

二、稅務注銷：在清算完成后，清算組成員應到所屬稅務機關辦理稅務注銷手續，領取稅務注銷證明。如果稅務機關認為企業有未繳稅款，注銷將無法進行，需要處理稅款后再行注銷。

三、銀行注銷：在清算完成后，清算組成員應到企業開戶銀行注銷企業銀行賬戶。如果企業有銀行債務，需要清償后方可完成銀行注銷手續。

四、社保注銷：在企業注銷前，必須到所屬社會保險機構辦理社保注銷手續。如果企業沒有及時繳納社保，也可能會出現糾紛問題。

五、注銷所需資料：企業在進行注銷時需要準備相應的證明文件，如營業執照、稅務注銷證明、開戶銀行注銷證明、清算方案等。如果缺少相應證明文件，可能會導致注銷手續無法順利進行。

六、注銷時間：在深圳注銷一家公司的時間一般需要2-5個月以上。如果注銷流程中出現問題，時間和費用都會受到影響。

七、費用：在深圳注銷一家公司的費用一般在2000-5000元左右，具體還要看公司的情況。如果企業有異常，注銷費用會更高。

總之，深圳企業在辦理注銷手續時，一定要注意以上幾點糾紛風險，避免產生不必要的訴訟和費用。同時，企業應該及時注銷，防止經營異常帶來的不良影響。如果不確定注銷流程，可以委托相關服務機構代理辦理，節省時間和精力。