深圳祖輩房產登記需要根據不同戶口本進行辦理，具體流程如下

1. 了解不同戶口本登記的要求

深圳市不同戶口本登記的要求可能會有所不同，需要先了解所持戶口本的相關規定，包括戶口本的有效期、戶口本的完整性等。同時，還需要了解房產登記的相關規定，包括房產證的有效期、房產證的完整性等。

2. 準備相關材料

準備好所持戶口本、祖輩房產證、身份證等相關材料，并確保材料的完整性和有效性。如果需要進行公證等手續，還需要提前辦理相關手續。

3. 前往當地房產登記中心辦理登記手續

前往當地房產登記中心辦理登記手續，根據所持戶口本的要求進行辦理。在辦理過程中，需要填寫相關申請表格、繳納相關費用等。

4. 等待審批結果

提交申請后，需要等待相關部門的審批結果。如果審批通過，就可以領取相關證明文件并辦理相關手續。

需要注意的是，不同戶口本登記的具體流程可能會有所不同，需要根據自身情況進行具體操作。此外，辦理過程中還需要遵守相關法規，確保操作合法、規范。