當一家深圳企業注銷時，員工的工資問題也需要妥善處理。在處理工資問題時，企業要考慮以下幾個方面：職工工資清算、社保繳納、個人所得稅申報等。

一、職工工資清算

對于已離職的職工，企業應該在規定的時間內結清他們的工資。除了公司基本工資之外，還需要結算加班工資、績效獎金、年終獎等。并且，企業在結算職工的工資時必須遵守《勞動合同法》和相關政策法規的規定。

二、社保繳納

企業注銷后，仍然需要將職工社保繳納清楚，以保障職工的福利權益。在繳納社保時，需要考慮到職工已經離職的情況，需要及時向社保部門申報，撤銷對職工的社保繳納。

三、個人所得稅申報

企業注銷過后，仍需對職工的個人所得稅進行申報。所得稅申報要按照規定的時間提交申報材料，以免影響職工的個人所得稅的退稅申領。

企業在辦理注銷過程中，需要妥善處理好職工工資的問題，尊重職工勞動權益，防范因工資清算問題而造成的法律糾紛。除此之外，企業在注銷前也應提前告知職工相關事宜，并告知他們在注銷后與企業保持聯系的方式，以便他們及時行使自身的權益。

在綜合了解了深圳企業注銷流程和注意事項后，企業在決定注銷前，應該認真考慮后果及風險，并積極妥善處理營業執照注銷相關事宜。同時，企業可以聘請相關專業機構來協助進行相關的事務處理，以提高注銷辦理效率。